A Magyar Közlönyben megjelent  határozatok valamennyi alapítványt közérdekű vagyonkezelőként határozzák meg. Az alapítványok feletti alapítói jogok gyakorlására az innovációért és technológiáért felelős minisztert jelölte ki a kormány. A fenntartói - mint vagyoni értékű - jogot az alapítványok kapták.

A Marek József Alapítvány - a fenntartói jog átruházásának megvalósítása érdekében - 300 millió, az induló vagyon fedezésére 600 millió, míg az idei működésre 200 millió forint támogatásban részesült. Jövőre és azt követően a működésre évi 400 millió forintot kap az alapítvány a központi költségvetésből.

Ugyan ezeket a támogatási összegeket, ugyanilyen bontásban kapta a többi alapítvány is, vagyis a Moholy-Nagy Művészeti Egyetemért Alapítvány, a Neumann János Egyetemért Alapítvány, a Soproni Egyetemért Alapítvány, a Széchenyi István Egyetemért Alapítvány, valamint az Universitas Miskolcinensis Alapítvány is.